Study finds no link between autism and gut microbes

Traduction : J.V.

Une étude ne révèle aucun lien entre l'autisme et les microbes intestinaux

Emily Anthes - 5 novembre 2012 

Controverse bactérienne

Certaines études ont trouvé certaines espèces bactériennes chez les enfants atteints d'autisme et non chez les témoins, mais une nouvelle étude affirme qu'il n'y a aucune différence entre les groupes. Contredisant une hypothèse populaire dans l'autisme, une nouvelle étude d'Australie n’a trouvé aucun lien entre l'autisme et les bactéries dans l'intestin. 

L'analyse, publiée le 20 Septembre dans la revue « Autism Research », rapporte que les systèmes gastro-intestinaux (GI) des enfants atteints d'autisme comportent les mêmes bactéries que celles développées typiquement dans leur fratrie 1. "Notre conclusion était qu’il n'y a aucun organisme que l'on peut identifier comme étant toujours impliqué dans l'autisme», explique Enzo Palombo, professeur agrégé de microbiologie à l'Université de Technologie de Swinburne à Melbourne, en Australie, qui est l'un des chercheurs. 

Basé sur 51 enfants atteints d'autisme et 53 frères et sœurs, l'étude est plus grande que la plupart des études sur le microbiome - la collecte des microbes dans le corps - chez les enfants atteints d'autisme. 

Comme les frères et sœurs partagent gènes et leur environnement, cette approche permet de réduire le «bruit» dans les données des facteurs non liés à l'autisme, selon les chercheurs. Cependant, des critiques soutiennent que parce que les enfants d'une même famille ont tendance à avoir des microbiomes similaires, comparer les enfants qui souffrent d'autisme avec leurs frères et sœurs non atteints peut également rendre plus difficile de repérer des anomalies subtiles associées à l'autisme. 

Pendant des années, les scientifiques ont soupçonné que quelque chose n’allait pas dans les intestins d'enfants atteints d'autisme. 

Plusieurs études ont montré, par exemple, que ces enfants souffrent de problèmes gastro-intestinaux à des taux beaucoup plus élevés que les autres enfants 2 3 4.

L'analyse des bactéries intestinales chez les enfants atteints de la maladie a révélé quelques conclusions provocantes. Par exemple, une étude réalisée en 2005 a révélé que les enfants sur le spectre de l'autisme ont des niveaux élevés de Clostridia, une classe de bactéries qui peuvent produire des neurotoxines, dans leurs intestins 5. 

Et dans une étude de cette année, les chercheurs ont constaté une classe de bactéries appelées Sutterella chez les enfants qui ont à la fois l'autisme et des troubles gastro-intestinaux, mais pas dans des contrôles avec un développement normal. 

Certains chercheurs sont même allés jusqu'à suggérer que ces populations microbiennes atypiques peuvent activement contribuer aux symptômes de l'autisme. 

Par exemple, la recherche a montré l'année dernière que les acides gras produits par les bactéries intestinales peuvent altérer le cerveau et le comportement 6 7. 

Lien obscur

C'est une proposition controversée, en particulier parce que le lien entre l'autisme et les microbes intestinaux reste trouble. Jusqu'à présent, les études ont été faibles et leurs résultats contradictoires, impliquant différents types de bactéries. 

Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont séquencé l'ADN extrait à partir des selles de 51 enfants atteints d'autisme et de 53 de leurs frères et sœurs non atteints, tous âgés entre 2 et 12. Les chercheurs ont alors comparé les séquences contre une base de données de génomes bactériens pour identifier les microbes dans chaque échantillon. 

Il n'y a pas de différences significatives dans les types de bactéries ou leurs niveaux entre les enfants autistes et leurs frères et sœurs qui se développent normalement, selon les chercheurs. Ils n'ont pas trouvé de différences entre les microbes intestinaux des enfants autistes qui ont des symptômes gastro-intestinaux et ceux qui n'en ont pas, ou entre les enfants atteints de formes sévères de l'autisme et ceux qui ont des formes légères de la maladie. "Nous montrons que le lien entre les bactéries spécifiques dans l'intestin et les symptômes autistiques et le comportement n'est pas défini», explique Palombo. 

Cependant, d'autres chercheurs disent que c'est trop tôt pour rejeter l'idée que les bactéries intestinales jouent un rôle dans l'autisme. «En général, je pense que c'est une étude bien gérée», explique Sydney Finegold, professeur émérite de médecine à l'Université de Californie, Los Angeles. 

Finegold complimente les chercheurs australiens, en particulier, pour leur échantillon de grande taille, et pour avoir inclus à la fois les enfants avec et sans problèmes gastro-intestinaux. Mais, il ajoute: «Je suis en désaccord avec la conclusion selon laquelle il n'y a pas de relation entre les bactéries intestinales et la dysfonction gastro-intestinale et l'autisme." 

D'une part, selon Finegold, les résultats de l'étude peuvent être faussées par l'utilisation d'antibiotiques. Palombo et ses collègues ont exclu des enfants de leur étude lorsqu’ils avaient pris des antibiotiques au cours des 15 jours précédents, mais Finegold dit qu'il croit que ce critère n'est pas suffisamment rigoureux. «Nous savons que l'impact des antibiotiques sur les bactéries intestinales dure pendant des mois, et certains diraient des années», dit-il. Il dit que ces études devraient de préférence exclure les enfants qui ont pris des antibiotiques à tout moment au cours des mois précédents. 

Pour sa part, Palombo dit: «Je suis d'accord qu'une période plus longue d’abstinence aurait été idéale, mais nous ne pouvions pas avoir eu d’assez nombreux participants pour l'étude." 

Des différences subtiles

Palombo convient qu'il est trop tôt pour se prononcer sur un lien entre les bactéries intestinales et l'autisme. Une poignée d'enfants atteints d'autisme ont diverses anomalies bactériennes, telles que un niveau élevé d'une espèce ou d'une autre, dit-il, indiquant qu'un sous-ensemble des enfants atteints de la maladie peuvent présenter des différences. 

Certains experts affirment qu’en comparant des microbes intestinaux des enfants autistes avec ceux de leurs frères et sœurs non atteints, plutôt que des contrôles indépendants, il peut être plus difficile de détecter des différences subtiles. 

"L'autisme est une étiologie complexe», explique Catherine Lozupone, une stagiaire postdoctorale dans le laboratoire de Rob Knight de l'Université du Colorado à Boulder. «Il y a une base génétique pour lui et il y a une base environnementale pour lui." 

Frères et sœurs partagent de nombreux gènes et expositions environnementales, on peut s'attendre à avoir des microbiomes similaires. En fait, certaines recherches ont montré que, tandis que les microbes intestinaux des enfants autistes sont très différents de ceux des contrôles indépendants, frères et sœurs ont des populations microbiennes qui se situent dans la moyenne 5 8. 

Prochains plans de l'équipe australienne pour chercher des différences dans les populations virales parmi ces groupes, ainsi que pour étudier si les bactéries chez les enfants autistes produisent des métabolites différents de ceux des enfants qui se développent normalement.

Dans l'ensemble, les résultats contradictoires de ces études pourraient résulter du fait qu'il n'y a pas encore d'une manière standard unique pour mener cette recherche, dit Lozupone. En plus d'utiliser différents types de populations témoins, les chercheurs peuvent recueillir l'ADN microbien à partir d'échantillons fécaux ou, occasionnellement, directement d’une biopsie de l'intestin. 

Certains scientifiques comparent la présence de certaines espèces ou de genres, et d'autres recherchent des différences dans les familles ou catégories de bactéries, qui peuvent masquer des différences subtiles à la plus fine, du niveau de l'espèce. 

"Il est vraiment difficile d'interpréter les résultats du microbiome», dit Lozupone. «C'est un nouveau domaine - nous en sommes encore à essayer de comprendre comment analyser les données."

1: Gondalia S.V. et al. Autism Res. Epub ahead of print (2012) PubMed

2: Valicenti-McDermott M. et al. J. Dev. Behav. Pediatr. 27, S128-S136 (2006) PubMed

3: Gilger M.A. and C.A. Redel Pediatrics 124, 796-798 (2009) PubMed

4: Horvath K. and J.A. Perman Curr. Opin. Pediatr. 14, 583-587 (2002) PubMed

5: Parracho H.M. et al. J. Med. Microbiol. 54, 987-991 (2005) PubMed

6: MacFabe D.F. et al. Behav. Brain Res. 176, 149-169 (2007) PubMed

7: Shultz S.R. et al. Neuropharmacology 54, 901-911 (2008) PubMed

8: Finegold S.M. et al. Anaerobe 16, 444-453 (2010) PubMed

Commentaires :Cet article complète deux articles publiés sur AIS (mais le mot-clé est différent : Sutterella et bactérie).

http://autisme-info.blogspot.fr/2012/02/microbial-association-with-autism.html

http://autisme-info.blogspot.fr/2012/07/autisme-la-piste-bacterienne.html

Il y a plusieurs commentaires sur le site de la SFARI, disant que le titre de l'article est trompeur, dans la mesure où l'article est plus nuancé, et qu'il renvoie aussi aux articles sur Sutterella. 

D'autre part, un spécialiste du sujet, Paul H Patterson, écrit le 16/11 :

I also find the title of this piece misleading. In Fig. 4 of the article, one finds that there are indeed differences in the microbial content of the ASD samples. These are apparently the less abundant species and so they do not contribute much to the overall "weighted" analysis. However, we all know that even a single species can give us great GI discomfort on occasion!
Another point is that prior studies did not agree on the same species as being different in ASD. This could be due to the fact that these several studies did not use the same experimental methods of sample collection and data analysis.

Traduction : "Je trouve aussi le titre trompeur. Dans la Fig. 4 de l'article [publié par Autism Research], on trouve qu'il y a effectivement des différences dans la teneur microbienne des échantillons de TSA. Ce sont apparemment les espèces moins abondantes et donc elles ne contribuent pas beaucoup à l'analyse globale «pondérée» . Cependant, nous savons tous que même une seule espèce peut nous donner un grand inconfort gastro-intestinal, à l'occasion!

Un autre point est que les études antérieures ne sont pas d'accord sur les mêmes espèces comme étant différentes dans les TSA. Cela pourrait être dû au fait que ces études différentes n'ont pas utilisé les mêmes méthodes expérimentales de prélèvement d'échantillons et d'analyse des données."