Genetic variation in GABRB3 is associated with Asperger syndrome and multiple endophenotypes relevant to autism

Traduction: G.M.

Mol Autism. 2013 Dec 9;4(1):48. [Epub ahead of print]

La variation génétique dans GABRB3 est associée avec le syndrome d'Asperger et de multiples endophénotypes pertinentes dans l'autisme

Warrier V, Baron-Cohen S, Chakrabarti B.

Abstract

CONTEXTE

Les Conditions du spectre autistique (ASC ) sont associées à des déficits dans les interactions sociales et la communication , aux côtés comportement stéréotypés répétitifs , limités , et restreints . L'ASC est fortement héréditaire . Le système de l'acide gamma-aminobutyrique ( GABA )-ergique a été associé de façon consistante avec des atypicités dans l'autisme , dans des études à la fois d'association et d'expression génétique .  
Une composante clé du système GABAergique est codée par le gène GABRB3 , qui a déjà été impliqué à la fois dans l'ASC et les différences individuelles dans l'empathie . 

MÉTHODES

Dans cette étude , 45 polymorphismes nucléotidiques simples génotypés ( SNP ) dans GABRB3 ont été testés pour l'association avec le syndrome d'Asperger ( S A) , et liés à des traits quantitatifs mesurés par les tests suivants: le Quotient empathique ( Q E​​) , le Quotient du spectre autistique ( AQ ) , le Quotient de Systématisation révisé ( SQ- R ) , le test des figures intégrées( EFT ) , le test de la lecture de l'esprit dans les yeux  ( RMET ) , et le test de rotation mentale ( MRT ) . Les analyses d'haplotypes de deux loci , trois loci , quatre loci , et une analyse d'haplotype sept loci ont également été réalisées dans les échantillons de contrôle avec AS. 

RÉSULTATS

Trois SNP rs7180158 ( , rs7165604 , rs12593579 ) étaient significativement associés au SA et deux SNP rs9806546 ( , rs11636966 ) étaient significativement associés au  EQ . Deux paires SNP- SNP rs1035751 , rs12438141 - et - rs12438141 rs7179514 , ont montré une association significative avec la variation dans les résultats de l'EFT . Une paire SNP- SNP , rs7174437 - rs1863455 , était significativement associée à la variation dans les scores de MRT . En outre, quelques haplotypes , y compris une région génomique de 19 kb qui a formé un block de  déséquilibre de liaison (DL )  dans notre échantillon et contenait plusieurs SNP nominalement importants , ont été trouvés comme étant associés de façon significative avec le SA. 

CONCLUSION

La présente étude confirme le rôle de GABRB3 comme un gène candidat important à la fois dans le CSA et dans la variation normative des endophénotypes (Note de traduction : terme utilisé en épidémiologie génétique pour analyser les symptômes comportementaux en phénotypes plus stables avec un lien génétique clair) associés.

PMID: 24321478


BACKGROUND:
Autism spectrum conditions (ASC) are associated with deficits in social interaction and communication, alongside repetitive, restricted, and stereotyped behavior. ASC is highly heritable. The gamma-aminobutyric acid (GABA)-ergic system has been associated consistently with atypicalities in autism, in both genetic association and expression studies. A key component of the GABA-ergic system is encoded by the GABRB3 gene, which has been previously implicated both in ASC and in individual differences in empathy.
METHODS:
In this study, 45 genotyped single nucleotide polymorphisms (SNPs) within GABRB3 were tested for association with Asperger syndrome (AS), and related quantitative traits measured through the following tests: the Empathy Quotient (EQ), the Autism Spectrum Quotient (AQ), the Systemizing Quotient-Revised (SQ-R), the Embedded Figures Test (EFT), the Reading the Mind in the Eyes Test (RMET), and the Mental Rotation Test (MRT). Two-loci, three-loci, four-loci haplotype analyses, and one seven-loci haplotype analysis were also performed in the AS case--control sample.
RESULTS:
Three SNPs (rs7180158, rs7165604, rs12593579) were significantly associated with AS, and two SNPs (rs9806546, rs11636966) were significantly associated with EQ. Two SNP-SNP pairs, rs12438141-rs1035751 and rs12438141-rs7179514, showed significant association with variation in the EFT scores. One SNP-SNP pair, rs7174437-rs1863455, was significantly associated with variation in the MRT scores. Additionally, a few haplotypes, including a 19 kb genomic region that formed a linkage disequilibrium (LD) block in our sample and contained several nominally significant SNPs, were found to be significantly associated with AS.
CONCLUSION:
The current study confirms the role of GABRB3 as an important candidate gene in both ASC and normative variation in related endophenotypes.