Quelle est la composition du microbiote intestinal sain? Un écosystème en mutation en fonction de l'âge, de l'environnement, de l'alimentation et des maladies

Aperçu: G.M.

Chaque individu reçoit un profil de microbiote intestinal unique qui remplit de nombreuses fonctions spécifiques dans le métabolisme des aliments de l'hôte, le maintien de l'intégrité structurelle de la barrière muqueuse intestinale, l'immunomodulation et la protection contre les agents pathogènes. Le microbiote intestinal est composé de différentes espèces de bactéries classées taxonomiquement par genre, famille, ordre et phyla. Les microbiotes intestinaux de chaque être humain se forment au tout début de la vie, car leur composition dépend des transitions du nourrisson (date de gestation à la naissance, type d'accouchement, méthodes d'alimentation du lait, période de sevrage) et de facteurs externes tels que l'utilisation d'antibiotiques. Ces microbiotes natifs personnels et sains restent relativement stables à l’âge adulte, mais diffèrent d’un individu à l’autre en raison des entérotypes, du niveau d’indice de masse corporelle (IMC), de la fréquence des exercices, du mode de vie ainsi que des habitudes culturelles et alimentaires. En conséquence, il n’existe pas de composition optimale du microbiote intestinal, car elle est différente pour chaque individu. Cependant, un équilibre sain entre le micro-organisme hôte et le micro-organisme doit être respecté afin d’exercer de manière optimale les fonctions métaboliques et immunitaires et de prévenir le développement de la maladie. Cette revue donnera un aperçu des études qui se concentrent sur les bilans de microbiote intestinal chez un même individu et entre individus, et mettra en évidence la relation mutualiste étroite entre les variations et les maladies du microbiote intestinal. En effet, la dysbiose du microbiote intestinal est associée non seulement à des troubles intestinaux, mais également à de nombreuses maladies extra-intestinales telles que des troubles métaboliques et neurologiques. Comprendre la cause ou la conséquence de ces équilibres de microbiote intestinal sur le plan de la santé et de la maladie et savoir comment maintenir ou rétablir une composition de microbiote intestinal saine devrait être utile pour mettre au point des interventions thérapeutiques prometteuses.

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Microorganisms. 2019 Jan 10;7(1). pii: E14. doi: 10.3390/microorganisms7010014.

What is the Healthy Gut Microbiota Composition? A Changing Ecosystem across Age, Environment, Diet, and Diseases

Rinninella E^1,2, Raoul P³, Cintoni M⁴, Franceschi F^5,6, Miggiano GAD^7,8, Gasbarrini A^9,10, Mele MC^11,12.

Author information

1

UOC di Nutrizione Clinica, Dipartimento di Scienze Gastroenterologiche, Endocrino-Metaboliche e Nefro-Urologiche, Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS, 00168 Rome, Italy. emanuele.rinninella@unicatt.it.

2

Istituto di Patologia Speciale Medica, Università Cattolica del Sacro Cuore, 00168 Rome, Italy. emanuele.rinninella@unicatt.it.

3

Istituto di Patologia Speciale Medica, Università Cattolica del Sacro Cuore, 00168 Rome, Italy. pauline.raoul1@gmail.com.

4

Scuola di Specializzazione in Scienza dell'Alimentazione, Università di Roma Tor Vergata, 00133 Rome, Italy. marco.cintoni@gmail.com.

5

UOC di Medicina d'Urgenza e Pronto Soccorso, Dipartimento di Scienze dell'Emergenza, Anestesiologiche e della Rianimazione, Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS, 00168 Rome, Italy. francesco.franceschi@unicatt.it.

6

Istituto di Medicina Interna e Geriatria, Università Cattolica del Sacro Cuore, 00168 Rome, Italy. francesco.franceschi@unicatt.it.

7

UOC di Nutrizione Clinica, Dipartimento di Scienze Gastroenterologiche, Endocrino-Metaboliche e Nefro-Urologiche, Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS, 00168 Rome, Italy. giacintoabele.miggiano@unicatt.it.

8

Istituto di Patologia Speciale Medica, Università Cattolica del Sacro Cuore, 00168 Rome, Italy. giacintoabele.miggiano@unicatt.it.

9

Istituto di Patologia Speciale Medica, Università Cattolica del Sacro Cuore, 00168 Rome, Italy. antonio.gasbarrini@unicatt.it.

10

UOC di Medicina Interna e Gastroenterologia, Dipartimento di Scienze Gastroenterologiche, Endocrino-Metaboliche e Nefro-Urologiche, Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS, 00168 Rome, Italy. antonio.gasbarrini@unicatt.it.

11

UOC di Nutrizione Clinica, Dipartimento di Scienze Gastroenterologiche, Endocrino-Metaboliche e Nefro-Urologiche, Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS, 00168 Rome, Italy. mariacristina.mele@unicatt.it.

12

Istituto di Patologia Speciale Medica, Università Cattolica del Sacro Cuore, 00168 Rome, Italy. mariacristina.mele@unicatt.it.

Abstract

Each individual is provided with a unique gut microbiota profile that plays many specific functions in host nutrient metabolism, maintenance of structural integrity of the gut mucosal barrier, immunomodulation, and protection against pathogens. Gut microbiota are composed of different bacteria species taxonomically classified by genus, family, order, and phyla. Each human's gut microbiota are shaped in early life as their composition depends on infant transitions (birth gestational date, type of delivery, methods of milk feeding, weaning period) and external factors such as antibiotic use. These personal and healthy core native microbiota remain relatively stable in adulthood but differ between individuals due to enterotypes, body mass index (BMI) level, exercise frequency, lifestyle, and cultural and dietary habits. Accordingly, there is not a unique optimal gut microbiota composition since it is different for each individual. However, a healthy host⁻microorganism balance must be respected in order to optimally perform metabolic and immune functions and prevent disease development. This review will provide an overview of the studies that focus on gut microbiota balances in the same individual and between individuals and highlight the close mutualistic relationship between gut microbiota variations and diseases. Indeed, dysbiosis of gut microbiota is associated not only with intestinal disorders but also with numerous extra-intestinal diseases such as metabolic and neurological disorders. Understanding the cause or consequence of these gut microbiota balances in health and disease and how to maintain or restore a healthy gut microbiota composition should be useful in developing promising therapeutic interventions.

PMID:30634578

DOI:10.3390/microorganisms7010014