Génétique du trouble du spectre de l'autisme

Aperçu: G.M.

Le " trouble du spectre de l'autisme" (TSA) est un trouble neurodéveloppemental prévalent caractérisé par une interaction sociale altérée et des comportements stéréotypés. Les TSA ont une composante génétique forte et complexe, avec de multiples profils d'hérédité familiale et une estimation de jusqu'à 1000 gènes potentiellement impliqués. Au cours de la dernière décennie, les technologies génomiques ont permis des progrès rapides dans l'identification des gènes à risque pour les TSA. Dans ce chapitre, les chercheurs examinent la délinéation des gènes du trouble à partir d'études génétiques traditionnelles telles que le lien et l'association, puis ils se focalisent sur des études plus récentes utilisant des technologies génomiques telles que le génotypage à haut débit et le séquençage d'exome.

Handb Clin Neurol. 2018;147:321-329. doi: 10.1016/B978-0-444-63233-3.00021-X.

Genetics of autism spectrum disorder

Ramaswami G¹, Geschwind DH².

Author information

1

Program in Neurogenetics, Department of Neurology, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, CA, United States.

2

Program in Neurogenetics, Department of Neurology, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, CA, United States; Center for Autism Research and Treatment, Semel Institute, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, CA, United States; Department of Human Genetics, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, CA, United States. Electronic address: dhg@mednet.ucla.edu.

Abstract

Autism spectrum disorder (ASD) is a prevalent neurodevelopmental disorder characterized by impaired social interaction and stereotyped behaviors. ASD has a strong and complex genetic component, with multiple familial inheritance patterns and an estimate of up to 1000 genes potentially implicated. Over the past decade, genomic technologies have enabled rapid progress in the identification of risk genes for ASD. In this chapter, we review the delineation of ASD disease genes starting from traditional genetic studies such as linkage and association, and then focusing on more recent studies utilizing genomic technologies, such as high-throughput genotyping and exome sequencing.

PMID:29325621

DOI:10.1016/B978-0-444-63233-3.00021-X

Le phénotype du "trouble de spectre de l'autisme" lié à TBR1 et à son "spectre" clinique

Aperçu: G.M.

Une gamme variée d'aberrations génétiques peut conduire au "Trouble du Spectre de l'Autisme" (TSA) et beaucoup d'entre elles ont été identifiées par le séquençage de nouvelle génération (NGS) dans le cadre d'études de consortium à grande échelle. Le TSA est un trouble phénotypiquement variable et des descriptions cliniques détaillées sont essentielles pour apprécier les relations génotype-phénotype.  

Dans ce rapport, les chercheurs fournissent une description clinique complète d'un enfant avec un diagnostic de TSA (dTSA) lequel un variant TBR1 a été identifié. Ils examinent ce cas dans le contexte de la littérature TBR1 actuelle et mettent en évidence le spectre variable du trouble associé à ce gène. Les informations phénotypiques décrites dans la littérature sont incomplètes, illustrant les limites des études de séquençage massivement parallèles en ce qui concerne l'annotation clinique. L'équipe suggère que les futures rapports de variantes TSA devraient inclure des descriptions phénotypiques normalisées. Cela permettrait de développer une compréhension plus approfondie de la relation génotype-phénotype, permettant ainsi de mieux conseiller et soutenir les personnes.

Eur J Med Genet. 2017 Dec 26. pii: S1769-7212(17)30427-5. doi: 10.1016/j.ejmg.2017.12.009.

The TBR1-related autistic-spectrum-disorder phenotype and its clinical spectrum

McDermott JH¹, Study DDD², Clayton-Smith J³, Briggs TA⁴.

Author information

1

Manchester Centre for Genomic Medicine, St Mary's Hospital, Manchester University Hospitals, NHS Foundation Trust Manchester Academic Health Sciences Centre, United Kingdom; Division of Evolution and Genomic Sciences, School of Biological Sciences, University of Manchester, Manchester, United Kingdom. Electronic address: john.mcdermott2@cmft.nhs.uk.

2

Wellcome Trust Sanger Institute, Cambridgeshire, United Kingdom.

3

Manchester Centre for Genomic Medicine, St Mary's Hospital, Manchester University Hospitals, NHS Foundation Trust Manchester Academic Health Sciences Centre, United Kingdom; Division of Evolution and Genomic Sciences, School of Biological Sciences, University of Manchester, Manchester, United Kingdom.

4

Manchester Centre for Genomic Medicine, St Mary's Hospital, Manchester University Hospitals, NHS Foundation Trust Manchester Academic Health Sciences Centre, United Kingdom; Division of Evolution and Genomic Sciences, School of Biological Sciences, University of Manchester, Manchester, United Kingdom. Electronic address: tracy.briggs@manchester.ac.uk.

Abstract

A diverse range of genetic aberrations can lead to Autistic Spectrum Disorder (ASD) and many of these have been identified via Next Generation Sequencing (NGS) as part of large scale consortium studies. ASD is a phenotypically variable disorder and detailed clinical descriptions are essential to appreciate genotype-phenotype relationships. In this report, we provide a comprehensive clinical description of a child with ASD in whom a TBR1 variant was identified. We review this case in the context of the current TBR1 literature and highlight the variable spectrum of disease associated with this gene. The phenotypic information outlined within the literature is incomplete, exemplifying the limitations of massively-parallel sequencing studies with regards to clinical annotation. We suggest that future reporting of ASD variants should include standardised phenotypic descriptions. This would develop a more thorough understanding of genotype-phenotype relationship, so allowing us to better counsel and support our patients.

PMID:29288087

DOI:10.1016/j.ejmg.2017.12.009