Métabolomique non ciblée des "troubles du spectre de l'autisme" : état actuel et perspectives

Aperçu: G.M.

Les "troubles du spectre de l'autisme" (TSA) constituent un groupe de troubles du développement neurologique caractérisé par des déficits dans l'enfance de la communication et des interactions sociales. Bien que l'étiologie exacte de la plupart des cas de TSA ne soit pas connue, il a été proposé qu'une partie soit associée à diverses anomalies métaboliques, notamment un dysfonctionnement mitochondrial, des troubles du métabolisme du cholestérol et des anomalies du folate. Des tests biochimiques ciblés tels que les profils plasmatiques d'acides aminés et d'acylcarnitine ont montré une utilité limitée pour aider au diagnostic et à la prise en charge de tels patients. La métabolomique non ciblée est toutefois devenue un outil prometteur pour le dépistage des anomalies biochimiques sous-jacentes et la gestion du traitement, ainsi que pour la recherche de nouveaux biomarqueurs potentiels du trouble. Ici, nous passons en revue les principes et la méthodologie qui sous-tendent la métabolomique non ciblée, les récentes études pilotes utilisant cette technologie et les domaines dans lesquels elle pourrait être intégrée dans les soins aux enfants de ce trouble à l’avenir.

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Front Psychiatry. 2019 Sep 10;10:647. doi: 10.3389/fpsyt.2019.00647. eCollection 2019.

Untargeted Metabolomics for Autism Spectrum Disorders: Current Status and Future Directions

Glinton KE¹, Elsea SH¹.

Author information

1

Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, TX, United States.

Abstract

Autism spectrum disorders (ASDs) are a group of neurodevelopment disorders characterized by childhood onset deficits in social communication and interaction. Although the exact etiology of most cases of ASDs is unknown, a portion has been proposed to be associated with various metabolic abnormalities including mitochondrial dysfunction, disorders of cholesterol metabolism, and folate abnormalities. Targeted biochemical testing like plasma amino acid and acylcarnitine profiles have demonstrated limited utility in helping to diagnose and manage such patients. Untargeted metabolomics has emerged, however, as a promising tool in screening for underlying biochemical abnormalities and managing treatment and as a means of investigating possible novel biomarkers for the disorder. Here, we review the principles and methodology behind untargeted metabolomics, recent pilot studies utilizing this technology, and areas in which it may be integrated into the care of children with this disorder in the future.

PMID:31551836

PMCID:PMC6746843

DOI:10.3389/fpsyt.2019.00647

Des mutations de novo à des interventions thérapeutiques personnalisées dans l'autisme

Traduction: G.M.

Annu Rev Med. 2015 Jan 14;66:487-507. doi: 10.1146/annurev-med-091113-024550.

From de novo mutations to personalized therapeutic interventions in autism

Brandler WM¹, Sebat J.

Author information

• ¹Beyster Center for Genomics of Psychiatric Diseases.

Résumé

La forte héritabilité, l'apparition précoce et les inconvénients de la reproduction dans les troubles du spectre autistique (TSA) sont compatibles avec une étiologie composée de mutations de novo (spontanées) dominantes. La détection de mutations par l'analyse des microréseaux et le séquençage de l'ADN a confirmé que des variations du nombre de copies de novo ou des mutations ponctuelles dans les régions codant pour des protéines de gènes contribuent au risque, et certaines des variantes et des gènes sous-jacents en cause ont été identifiés. Comme notre compréhension des gènes de l'autisme se développe, le spectre de l'autisme se désagrège en quanta (Note de traduction: quantité minimale d'une grandeur physique pouvant séparer deux valeurs de cette grandeur) de nombreux troubles génétiques différents. 
Compte tenu de la diversité des étiologies et des voies biochimiques sous-jacentes, le traitement personnalisé des TSA est logique, et les tests génétiques cliniques sont une condition préalable.

PMID: 25587659

Abstract

The high heritability, early age at onset, and reproductive disadvantages of autism spectrum disorders (ASDs) are consistent with an etiology composed of dominant-acting de novo (spontaneous) mutations. Mutation detection by microarray analysis and DNA sequencing has confirmed that de novo copy-number variants or point mutations in protein-coding regions of genes contribute to risk, and some of the underlying causal variants and genes have been identified. As our understanding of autism genes develops, the spectrum of autism is breaking up into quanta of many different genetic disorders. Given the diversity of etiologies and underlying biochemical pathways, personalized therapy for ASDs is logical, and clinical genetic testing is a prerequisite.