08 juillet 2018

L'exposition prénatale à des agressions environnementales et un risque accru de développer la schizophrénie et les "troubles du spectre de l'autisme": Focus sur les voies biologiques et les mécanismes épigénétiques

Aperçu: G.M.
Les troubles neurodéveloppementaux (DSN), la schizophrénie (SZ) et le "trouble du spectre de l'autisme" (TSA) sont considérés comme parmi les plus graves en termes de prévalence, de morbidité et d'impact sur la société. Des caractéristiques similaires et des symptômes qui se chevauchent ont été observés à plusieurs niveaux, suggérant des bases physiopathologiques communes. En effet, de récentes études d'association à l'échelle du génome (GWAS) et des données épidémiologiques rapportent des gènes de vulnérabilité et des déclencheurs environnementaux à travers les deux troubles.  
Dans cette revue, les auteurs discuteront des mécanismes biologiques possibles, y compris les neurotransmissions glutamatergiques et GABAergiques, les signaux inflammatoires et les systèmes liés au stress oxydatif, qui sont ciblés par des expositions environnementales défavorables et qui ont été associés au développement de SZ et du TSA.  
Les auteurs discuteront également du rôle émergent du microbiome intestinal en tant qu'interaction possible entre l'environnement, le système immunitaire et le développement du cerveau. Enfin,ils   décriront l'implication des mécanismes épigénétiques dans le maintien des effets durables des environnements défavorables au début de la vie. Cela nous permettra de mieux comprendre la physiopathologie de ces DSN et d'identifier de nouvelles cibles pour de futures stratégies de traitement.
Extraits ... conclusion
Dans cette revue, nous présentons une image complexe illustrant le rôle du stress prénatal et des infections prénatales comme principaux effets indésirables du neurodéveloppement qui augmentent la vulnérabilité de la SZ et des TSA en agissant sur plusieurs systèmes biologiques, dont la neurotransmission, l'inflammation et le stress oxydant. .Nous avons décrit, en détail, les altérations des mécanismes inflammatoires, à la fois en termes de cytokines périphériques et de chimiokines, de populations de cellules immunitaires et d'activation de la microglie, en se concentrant principalement sur les similitudes et les différences entre les deux troubles. Comme interconnecté avec le système immunitaire, nous avons également spéculé sur le rôle possible du microbiome intestinal dans l'interaction entre l'environnement, l'inflammation et le développement du cerveau.En rassemblant les données récentes acquises dans ce contexte, notre objectif était de mettre en évidence des points convergents d'agressions environnementales distinctes et des systèmes dérégulés qui pourraient fournir des cibles thérapeutiques et de recherche communes pour un large éventail de perturbations neurodéveloppementales.  
Parmi ceux-ci, le rôle du système immunitaire et du GMB dans la précipitation des anomalies neurodéveloppementales en réponse aux adversités de la vie précoce mérite un examen plus approfondi.  
De plus, les mécanismes épigénétiques sont également apparus comme un substrat biologique plausible à travers lequel les expositions environnementales prénatales peuvent perturber le développement normal du cerveau et induire des effets durables sur le fonctionnement et le comportement du cerveau; par conséquent, des efforts supplémentaires devraient être concentrés sur l'examen de ces mécanismes et de leur relation avec le milieu de la vie.  
Enfin, étant donné que différents systèmes biologiques jouent un rôle important dans la fonction cérébrale, de futures études ciblant ces médiateurs pourraient améliorer notre compréhension de la physiopathologie de la SZ et du TSA et faciliter l'identification de nouvelles cibles spécifiques pour de futures stratégies thérapeutiques. 

Neurosci Biobehav Rev. 2018 Jul 4. pii: S0149-7634(17)30972-7. doi: 10.1016/j.neubiorev.2018.07.001.

Prenatal exposure to environmental insults and enhanced risk of developing Schizophrenia and Autism Spectrum Disorder: Focus on biological pathways and epigenetic mechanisms

Author information

1
Biological Psychiatry Unit, IRCCS Fatebenefratelli San Giovanni di Dio, via Pilastroni 4, Brescia, Italy.
2
Institute of Pharmacology and Toxicology, University of Zurich-Vetsuisse, Zurich, Switzerland.
3
Biological Psychiatry Unit, IRCCS Fatebenefratelli San Giovanni di Dio, via Pilastroni 4, Brescia, Italy; Stress, Psychiatry and Immunology Laboratory, Department of Psychological Medicine, Institute of Psychiatry, King's College London, London, 125 Coldharbour Lane, SE5 9NU, London, UK. Electronic address: annamaria.cattaneo@kcl.ac.uk.

Abstract

When considering neurodevelopmental disorders (NDDs), Schizophrenia (SZ) and Autism Spectrum Disorder (ASD) are considered to be among the most severe in term of prevalence, morbidity and impact on the society. Similar features and overlapping symptoms have been observed at multiple levels, suggesting common pathophysiological bases. Indeed, recent genome-wide association studies (GWAS) and epidemiological data report shared vulnerability genes and environmental triggers across the two disorders. In this review, we will discuss the possible biological mechanisms, including glutamatergic and GABAergic neurotransmissions, inflammatory signals and oxidative stress related systems, which are targeted by adverse environmental exposures and that have been associated with the development of SZ and ASD. We will also discuss the emerging role of the gut microbiome as possible interplay between environment, immune system and brain development. Finally, we will describe the involvement of epigenetic mechanisms in the maintenance of long-lasting effects of adverse environments early in life. This will allow us to better understand the pathophysiology of these NDDs, and also to identify novel targets for future treatment strategies.

KEYWORDS:

DNA methylation; autism; biological systems; brain development; epigenetics; inflammation; microbiota; neurodevelopmental disorders; prenatal infections; prenatal stress; schizophrenia

Disparités dans la connaissance des déficiences développementales chez les parents à faible revenu

Aperçu: G.M.
Les connaissances des parents sur les déficiences développementales (DD) peuvent faciliter l'accès aux soins pour les DD; Cependant, les parents peuvent avoir une familiarité et des connaissances différentes  avec les DD courantes. Cette étude visait à évaluer les différences ethniques et linguistiques dans la familiarité, les connaissances et l'expérience personnelle des familles à faible revenu avec les DD.
Les auteurs ont mené une enquête sur le développement de l'enfant auprès de 539 parents de jeunes enfants à faible revenu fréquentant le Programme spécial de nutrition supplémentaire pour femmes, nourrissons et enfants (WIC) dans six comtés de l'Oregon en 2015. Les sujets de l'enquête évaluaient les DD,  les connaissances autodéclarées sur les DD et l'expérience personnelle avec un ami ou un membre de la famille avec un DD. Les analyses bivariables et multivariées ont évalué les différences de résultats entre les blancs non-latinos [blancs], latino compétents en anglais [latino-EP], latino- avec anglais limité [Latino-LEP], et non latino autre ethnie compétent en anglais .Dans l'ensemble, les parents ont correctement identifié 64,7% des signes précoces de DD. Les parents blancs ont correctement identifié les premiers signes, même après ajustement pour les facteurs sociodémographiques. Latino-LEP, Latino-EP et les autres parents étaient moins susceptibles d'avoir entendu parler de DDs tels que le TDAH et l'autisme, et étaient moins susceptibles d'avoir un ami ou un membre de la famille avec une DD par rapport aux parents blancs.Les Latino-LEP à faible revenu et les autres parents d'ethnie différentes ont moins de familiarité ou d'expérience personnelle avec les DD, et sont moins conscients des signes avant-coureurs de DD que les parents blancs à faible revenu. Les résultats de l'étude suggèrent que les interventions visant à réduire les disparités dans le diagnostic et le traitement de la DD devraient inclure un transfert accru d'information aux parents dans les communautés  ethniques et linguistiques minoritaires.Les parents minoritaires raciaux / ethniques, et en particulier les parents latino-américains ayant une connaissance limitée de l'anglais, ont moins de familiarité ou d'expérience personnelle avec les DD et sont moins conscients des signes précoces de DD que les parents blancs à faible revenu.
 
Acad Pediatr. 2018 Jul 4. pii: S1876-2859(18)30422-4. doi: 10.1016/j.acap.2018.06.011.

Disparities in Familiarity with Developmental Disabilities among Low-Income Parents

Author information

1
Division of General Pediatrics, Doernbecher Children's Hospital, Oregon Health & Science University, 707 SW Gaines St, Mail Code CDRC-P, Portland, OR, 97239; Oregon Health & Science University - Portland State University School of Public Health, 3181 SW Sam Jackson Park Road, Mail Code GH-230, Portland, OR, 97239. Electronic address: zuckerma@ohsu.edu.
2
Division of General Pediatrics, Doernbecher Children's Hospital, Oregon Health & Science University, 707 SW Gaines St, Mail Code CDRC-P, Portland, OR, 97239; Department of Psychology, University of Massachusetts Boston, 100 William T. Morrissey Blvd., Boston, MA, 02125.
3
Division of General Pediatrics, Doernbecher Children's Hospital, Oregon Health & Science University, 707 SW Gaines St, Mail Code CDRC-P, Portland, OR, 97239.
4
Division of General Pediatrics, Doernbecher Children's Hospital, Oregon Health & Science University, 707 SW Gaines St, Mail Code CDRC-P, Portland, OR, 97239; Massachusetts General Hospital for Children, Division of General Academic Pediatrics, 55 Fruit St., Boston, MA, 02114.
5
Oregon WIC Program, Oregon Health Authority, Portland, OR.

Abstract

OBJECTIVE:

Parent knowledge about developmental disabilities (DDs) may facilitate access to DD care; however, parents may vary in their knowledge and familiarity with common DDs. This study aimed to assess racial/ethnic and language differences in low-income families' familiarity, knowledge, and personal experience with DDs.

METHODS:

We conducted a child development survey among 539 low-income parents of young children attending visits at the Special Supplemental Nutrition Program for Women, Infants, and Children (WIC), in six Oregon counties in 2015. Survey items assessed parent familiarity with early signs of DDs, self-reported knowledge about DDs, and personal experience with a friend or family member with a DD. Bivariable and multivariable analyses assessed differences in outcomes among non-Latino white [white], Latino-English proficient [Latino-EP], Latino-limited English proficient [Latino-LEP], and non-Latino other race English proficient [other race] parents.

RESULTS:

Overall, parent participants correctly identified 64.7% of early signs of DDs. White parents correctly identified the earliest signs, even after adjustment for socio-demographic factors. Latino-LEP, Latino-EP and other race parents were less likely to have heard of prevalent DDs such as ADHD and autism, and were less likely to have a friend or family member with a DD compared to white parents.

CONCLUSIONS:

Low-income Latino-LEP and other race parents have less familiarity or personal experience with DDs, and are less aware of DD early signs compared to low-income white parents. Study findings suggest that interventions to reduce disparities in DD diagnosis and treatment should include increasing information transfer to parents in racial/ethnic and language minority communities.

WHAT'S NEW:

Low-income racial/ethnic minority parents, and particularly Latinos parents with limited English proficiency, have less familiarity or personal experience with DDs, and are less aware of DD early signs compared to low-income white parents.
PMID:29981380
DOI:10.1016/j.acap.2018.06.011

Clinicien vs Machine: Estimation des taux de vocalisations chez les jeunes enfants ayant des troubles du développement

Aperçu: G.M.
Le but de cette étude était d'étudier la fiabilité d'un système automatisé d'analyse de la langue, LENA, comparé à un transcripteur humain pour déterminer le taux de vocalisations des enfants durant les sessions d'enregistrement significativement plus courtes que celles recommandées pour l'appareil automatisé. .Les participants étaient 6 enfants mâles non verbaux âgés de 28 et 46 mois. Deux enfants avaient un diagnostic d'autisme, deux avaient un syndrome de Down, un avait une délétion chromosomique et un avait un retard de développement. Les participants ont été enregistrés par le processeur de langage numérique LENA au cours de 14 interactions de jeu avec un adulte réactif. Le taux de vocalisations des enfants au cours de chacun des 84 enregistrements a été déterminé à la fois par un transcripteur humain et par le logiciel LENA.Une différence statistiquement significative entre les deux méthodes a été observée pour 4 des 6 participants. Les tailles d'effet étaient modérées à grandes. La variation de la structure syllabique n'explique pas la différence entre les deux méthodes. Les taux de vocalisation des deux méthodes étaient fortement corrélés pour 5 des 6 participants.Les estimations des taux de vocalisation des enfants non verbaux produits par le système LENA différaient de la transcription humaine pendant les sessions qui étaient sensiblement plus courtes que la longueur d'enregistrement recommandée. 
Ces résultats confirment la recommandation de la Fondation LENA d'enregistrer des sessions d'au moins 1 heure.

Am J Speech Lang Pathol. 2018 Jun 11:1-7. doi: 10.1044/2018_AJSLP-17-0016.

Clinician vs. Machine: Estimating Vocalizations Rates in Young Children With Developmental Disorders

Author information

1
The Schiefelbusch Institute of Life Span Studies, University of Kansas, Lawrence.

Abstract

Purpose:

The purpose of this study was to investigate the reliability of an automated language analysis system, the Language Environment Analysis (LENA), compared with a human transcriber to determine the rate of child vocalizations during recording sessions that were significantly shorter than recommended for the automated device.

Method:

Participants were 6 nonverbal male children between the ages of 28 and 46 months. Two children had autism diagnoses, 2 had Down syndrome, 1 had a chromosomal deletion, and 1 had developmental delay. Participants were recorded by the LENA digital language processor during 14 play-based interactions with a responsive adult. Rate of child vocalizations during each of the 84 recordings was determined by both a human transcriber and the LENA software.

Results:

A statistically significant difference between the 2 methods was observed for 4 of the 6 participants. Effect sizes were moderate to large. Variation in syllable structure did not explain the difference between the 2 methods. Vocalization rates from the 2 methods were highly correlated for 5 of the 6 participants.

Conclusions:

Estimates of vocalization rates from nonverbal children produced by the LENA system differed from human transcription during sessions that were substantially shorter than the recommended recording length. These results confirm the recommendation of the LENA Foundation to record sessions of at least 1 hr.
PMID:29893787
DOI:10.1044/2018_AJSLP-17-0016

10 juin 2018

Tests génétiques et autisme: Tutoriel pour les sciences et les troubles de la communication

Aperçu: G.M.
Ce tutoriel fournit aux professionnels des sciences et des troubles de la communication un aperçu de la base moléculaire et des perceptions parentales des tests génétiques associés à l'autisme. L'introduction souligne l'importance des tests génétiques dans les pratiques médicales actuelles et souligne les limites et les préoccupations liées à la critique des handicaps. 
Le corps du tutoriel fournit un aperçu de quatre différentes formes de variation génétique, en soulignant les associations potentielles avec l'autisme et les tests génétiques disponibles.  
En résumé, la plupart des cas d'autisme ne peuvent pas être directement associés à des formes spécifiques de variation génétique, mais sont plutôt attribués à de multiples influences génétiques et environnementales agissant de concert.  
Enfin, la discussion porte sur les perceptions parentales des tests génétiques associés à l'autisme, à la fois sur les avantages et les inconvénients potentiels, et insiste sur la nécessité d'intégrer les perspectives personnelles des personnes autistes.

J Commun Disord. 2018 May 28;74:61-73. doi: 10.1016/j.jcomdis.2018.05.003.

Genetic testing and autism: Tutorial for communication sciences and disorders

Author information

1
Department of Speech & Hearing Science, University of Illinois, 901 S. Sixth Street, Champaign, IL, 61820, United States. Electronic address: lauras@illinois.edu.
2
Department of Cell and Developmental Biology, College of Medicine, University of Illinois, 601 S. Goodwin Ave Urbana, IL, 61801, United States. Electronic address: sceman@illinois.edu.

Abstract

This tutorial provides professionals in communication sciences and disorders with an overview of the molecular basis and parental perceptions of genetic testing as associated with autism. The introduction notes the prominence of genetic testing within present-day medical practices and highlights related limitations and concerns through the lens of disability critique. The body of the tutorial provides an overview of four different forms of genetic variation, highlighting the potential associations with autism and available genetic testing. In sum, most autism cases cannot be associated directly with specified forms of genetic variation but are attributed instead to multiple genetic and environmental influences working in concert. Finally, the discussion focuses on parental perceptions of the genetic testing associated with autism, both the potential benefits and harms, and emphasizes the need to integrate first-person perspectives from autistic individuals.
PMID:29879582
DOI:10.1016/j.jcomdis.2018.05.003

09 juin 2018

Une revue systématique des outils de dépistage chez les enfants non jeunes et les adultes avec un diagnostic de "trouble du spectre de l'autisme"

Aperçu: G.M.
Les revues des outils de dépistage des "troubles du spectre de l'autisme" (TSA) se concentrent sur les jeunes enfants, et tous les outils de dépistage n'ont pas été examinés par rapport à des procédures de diagnostic validées.
L'objectif de l'étude est d'examiner la validité des outils de dépistage du TSA chez les jeunes enfants et les adultes afin de fournir des recommandations cliniques sur l'utilisation de ces outils dans divers milieux cliniques.Des bases de données électroniques, y compris MEDLINE, EMBASE, PsychINFO, Cochrane Library et CINAHL, ont été consultées jusqu'en mars 2017. Études examinant la validité des outils de dépistage des TSA par rapport à l'ADOS et l'ADI pour les enfants et les adultes ont été incluses. Trois auteurs ont indépendamment revu chaque article pour l'extraction de données et l'évaluation de la qualité.14 études répondaient aux critères d'inclusion, dont 11 études étaient avec des enfants (4-18 ans) et 3 études incluaient seulement des adultes (19 ans et plus). Les études incluses ont été menées dans un échantillon de population générale / à faible risque (N = 3) et un échantillon cliniquement recommandé / à risque élevé (N = 11). Au total, 11 outils ont été inclus.Seuls trois outils de dépistage (le questionnaire sur le spectre de l'autisme, le questionnaire sur la communication sociale et l'échelle de la responsabilité sociale) ont été examinés dans plus de deux études. Ces outils peuvent aider à différencier les TSA des autres troubles neurodéveloppementaux et les enfants avec troubles psychiatriques des enfants au développement typique.  
Dans les populations de jeunes adultes, la rareté de la recherche existante dans ce groupe limite les conclusions définitives et les recommandations.

Res Dev Disabil. 2018 Jun 4;80:1-12. doi: 10.1016/j.ridd.2018.05.017.

A systematic review of screening tools in non-young children and adults for autism spectrum disorder

Author information

1
Child and Adolescent Psychiatry, Department of Psychiatry, Langley Porter Psychiatric Institute, University of California San Francisco, 401 Parnassus Avenue, San Francisco, CA, 94143, USA. Electronic address: tomoya.hirota@ucsf.edu.
2
Department of Psychiatry, Okayama Psychiatric Medical Center, 3-16 Shikatahonmachi, Kita-ward, Okayama, Okayama, 700-0915, Japan; Department of Health Promotion and Human Behavior, Kyoto University Graduate School of Medicine/School of Public Health, Kyoto, Japan.
3
Child and Adolescent Psychiatry, Department of Psychiatry, Langley Porter Psychiatric Institute, University of California San Francisco, 401 Parnassus Avenue, San Francisco, CA, 94143, USA.
4
Chapin Hall Center for Children at the University of Chicago, 1313 E 60th St., Chicago, IL, 60637, USA.

Abstract

BACKGROUND:

Existing reviews of screening tools for Autism Spectrum Disorder (ASD) focus on young children, and not all screening tools have been examined against validated diagnostic procedures.

AIMS:

To examine the validity of screening tools for ASD in non-young children and adults to provide clinical recommendations about the use of these tools in a variety of clinical settings.

METHODS AND PROCEDURES:

Electronic databases, including MEDLINE, EMBASE, PsychINFO, Cochrane Library and CINAHL, were searched through March 2017. Studies examining the validity of ASD screening tools against the Autism Diagnostic Observation Schedule and/or the Autism Diagnostic Interview - Revised in non-young children (age 4 or above) and adults were included. Three authors independently reviewed each article for data extraction and quality assessment.

OUTCOMES AND RESULTS:

14 studies met the inclusion criteria, of which 11 studies were with children (4-18 years of age) and 3 studies included adults only (19 years of age and above). Included studies were conducted in a general population/low-risk sample (N = 3) and a clinically referred/high-risk sample (N = 11). In total 11 tools were included.

CONCLUSIONS AND IMPLICATIONS:

Only three screening tools (the Autism-Spectrum Quotient, the Social Communication Questionnaire, and the Social Responsiveness Scale) were examined in more than 2 studies. These tools may assist in differentiating ASD from other neurodevelopmental and psychiatric disorders or typically developed children. In young adult populations, the paucity of the existing research in this group limits definitive conclusion and recommendations.

PMID:29879612
DOI:10.1016/j.ridd.2018.05.017

La coordination motrice interpersonnelle au cours des actions conjointes chez les enfants avec et sans "trouble du spectre de l'autisme": Le rôle de l'information motrice

Aperçu: G.M.
La cinématique joue un rôle clé dans la prédiction de l'action, l'imitation et la coordination des actions conjointes. Bien que les personnes ayant un diagnostic de "trouble du spectre de l'autisme (dTSA) montrent une déficience à utiliser des signaux cinématiques pendant l'observation et l'imitation, il existe peu d'études explorant le rôle de ce dysfonctionnement au cours des actions conjointes chez les enfants avec dTSA.
L'objectif de cette étude est d'évaluer la coordination motrice interpersonnelle des enfants avec dTSA et des enfants qui se développent typiquement (TD) au cours d'une tâche d'action conjointe.
Vingt-deux participants ont effectué deux tâches de coopération. Dans la première (Clear End-Point), les enfants ont reçu des informations a priori sur le point final du mouvement. Dans la seconde (End-Point Unclear), le point final était inconnu et les enfants devaient utiliser des indices cinématiques pour atteindre le but commun.  
Les chercheurs n'ont trouvé aucune différence entre les groupes dans la première tâche, même si les enfants avec dTSA affichaient une plus grande variabilité du temps de réaction. Dans la deuxième tâche, ils ont montré des mouvements moins précis et plus lents que les enfants TD. De plus, leurs caractéristiques de mouvement ne différaient pas entre les deux tâches, alors que les enfants TD ont montré une variabilité réduite du temps de réaction et du nombre d'erreurs dans la seconde tâche.Les enfants avec dTSA ont montré un déficit dans la coordination de l'action conjointe lorsqu'ils devaient compter uniquement sur l'information cinématique. Ils n'étaient pas capables de prêter plus d'attention aux signaux cinématiques en l'absence d'un objectif visuel. 

Res Dev Disabil. 2018 Jun 4;80:13-23. doi: 10.1016/j.ridd.2018.05.018.

Interpersonal motor coordination during joint actions in children with and without autism spectrum disorder: The role of motor information

Author information

1
IRCCS Stella Maris Foundation, Viale del Tirreno 331, 56018, Calambrone, Pisa, Italy.
2
Clinical Physiology Institute, National Research Council of Italy (IFC-CNR), Via Moruzzi 1, 56124 Pisa, Italy.
3
Department of Information Engineering, University of Pisa, Via Caruso, 56100 Pisa, Italy.
4
IRCCS Stella Maris Foundation, Viale del Tirreno 331, 56018, Calambrone, Pisa, Italy. Electronic address: acontaldo@fsm.unipi.it

Abstract

BACKGROUND:

Kinematics plays a key role in action prediction, imitation and joint action coordination. Despite people with autism spectrum disorder (ASD) show a failure to use kinematic cues during observation and imitation, there is a paucity of studies exploring the role of this dysfunction during joint actions in children with ASD.

AIM:

To evaluate the interpersonal motor coordination of children with ASD and typically developing (TD) children during a joint action task.

METHOD:

Twenty-two participants performed two cooperative tasks. In the first one (Clear End-Point), children were provided with a priori information on movement end-point. In the second one (Unclear End-Point), the end-point was unknown and children had to use kinematic cues to accomplish the shared goal.

RESULTS:

We found no between-group differences in the first task, even if children with ASD displayed greater reaction time variability. In the second task, they showed less accurate and slower movements than TD children. Moreover, their movement features did not differ between the two tasks, whereas TD children showed reduced reaction time variability and number of errors in the second task.

CONCLUSION:

Children with ASD were impaired in joint action coordination when they had to rely only on kinematic information. They were not able to pay more attention to the kinematic cues in absence of a visual goal.
PMID:29879613
DOI:10.1016/j.ridd.2018.05.018

04 juin 2018

Forte corrélation entre les gènes déréglés liés à la transmission synaptique et les mitochondries dans le cortex cérébral de l'autisme post-mortem

Aperçu: G.M.
Des études génétiques sur l'autisme ont mis en évidence un groupe hétérogène de loci et de gènes. En outre, l'environnement peut être un facteur supplémentaire conférant la susceptibilité à l'autisme. Les études sur le transcriptome étudient les différences quantitatives dans l'expression génique entre les tissus dérivés du patient et les contrôles. Ces études peuvent identifier des gènes pertinents pour la physiopathologie tout en évitant le besoin de comprendre l'architecture génétique ou les interactions gène par environnement menant au trouble.
L'équipe a effectué d'autres analyses d'enrichissement des ensembles de gènes en utilisant des gènes différentiellement exprimés d'une étude de séquençage de l'ARN (RNA-seq) publiée antérieurement sur le cortex cérébral autistique post-mortem. Les chercheurs ont utilisé trois ensembles de données de puces à ADN publiées précédemment pour la validation et l'un des ensembles de données de puces à ADN pour l'analyse d'expression différentielle supplémentaire.  
L'étude RNA-seq s'est fondée sur 26 cerveaux autistes et 33 témoins dans l'analyse de l'expression génique différentielle, et la plus grande base de données de microréseau contenait 15 cerveaux autistes et 16 cerveaux témoins post-mortem.Les chercheurs ont découvert que les gènes associés à la fonction mitochondriale étaient régulés à la baisse dans le cortex cérébral autiste par rapport au contrôle. Ces gènes étaient corrélés avec des gènes liés à la fonction synaptique. Ils ont validé ces résultats à travers les multiples ensembles de données de microarray. L'équipe a également séparé les analyses d'expression différentielle et d'enrichissement des ensembles de gènes pour confirmer l'importance de la voie mitochondriale parmi les gènes régulés à la baisse dans le cortex cérébral de l'autisme post-mortem.Ces résultats peuvent potentiellement se répliquer dans d'autres maladies, telles que la schizophrénie. 

J Neurodev Disord. 2018 Jun 1;10(1):18. doi: 10.1186/s11689-018-9237-x.

Strong correlation of downregulated genes related to synaptic transmission and mitochondria in post-mortem autism cerebral cortex

Author information

1
Department of Molecular Biology, Cell Biology and Biochemistry, and Carney Institute for Brain Science, Brown University, Providence, RI, 02912, USA.
2
Department of Human Genetics, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, 90095, USA.
3
Program in Neurogenetics, Department of Neurology, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, 90095, USA.
4
Department of Psychiatry and Kennedy Center for Research on Human Development, Vanderbilt University, Nashville, TN, 37203, USA.
5
Present address: Department of Psychiatry, Munroe-Meyer Institute, University of Nebraska Medical Center, Omaha, NE, 68198, USA.
6
Department of Molecular Biology, Cell Biology and Biochemistry, and Carney Institute for Brain Science, Brown University, Providence, RI, 02912, USA. eric_morrow@brown.edu.
7
Developmental Disorders Genetics Research Program, Emma Pendleton Bradley Hospital and Department of Psychiatry and Human Behavior, Alpert Medical School of Brown University, East Providence, RI, 02915, USA. eric_morrow@brown.edu.
8
Hassenfeld Child Health Innovation Institute, Brown University, Providence, RI, 02912, USA. eric_morrow@brown.edu.
9
Laboratories for Molecular Medicine, Brown University, 70 Ship Street, Box G-E4, Providence, RI, 02912, USA. eric_morrow@brown.edu.

Abstract

BACKGROUND:

Genetic studies in autism have pinpointed a heterogeneous group of loci and genes. Further, environment may be an additional factor conferring susceptibility to autism. Transcriptome studies investigate quantitative differences in gene expression between patient-derived tissues and control. These studies may pinpoint genes relevant to pathophysiology yet circumvent the need to understand genetic architecture or gene-by-environment interactions leading to disease.

METHODS:

We conducted alternate gene set enrichment analyses using differentially expressed genes from a previously published RNA-seq study of post-mortem autism cerebral cortex. We used three previously published microarray datasets for validation and one of the microarray datasets for additional differential expression analysis. The RNA-seq study used 26 autism and 33 control brains in differential gene expression analysis, and the largest microarray dataset contained 15 autism and 16 control post-mortem brains.

RESULTS:

While performing a gene set enrichment analysis of genes differentially expressed in the RNA-seq study, we discovered that genes associated with mitochondrial function were downregulated in autism cerebral cortex, as compared to control. These genes were correlated with genes related to synaptic function. We validated these findings across the multiple microarray datasets. We also did separate differential expression and gene set enrichment analyses to confirm the importance of the mitochondrial pathway among downregulated genes in post-mortem autism cerebral cortex.

CONCLUSIONS:

We found that genes related to mitochondrial function were differentially expressed in autism cerebral cortex and correlated with genes related to synaptic transmission. Our principal findings replicate across all datasets investigated. Further, these findings may potentially replicate in other diseases, such as in schizophrenia.
PMID:29859039
DOI:10.1186/s11689-018-9237-x

03 juin 2018

L'apprentissage statistique est associé aux symptômes de l'autisme et aux capacités verbales chez les jeunes enfants autistes

Aperçu: G.M.
Les régularités d'extraction de l'apprentissage statistique dans l'environnement peuvent être à l'origine de comportements sociaux complexes.  
124 enfants, dont 56 autistes et 68 non autistes, âgés de 2 à 8 ans, ont achevé une nouvelle tâche d'apprentissage statistique sur un iPad. En moyenne, les enfants autistes ont montré moins d'apprentissage sur la tâche que les enfants non autistes. Cependant, les analyses de classification multivariées ont caractérisé les comportements individuels et ont montré qu'un sous-groupe d'enfants autistes avait des schémas d'apprentissage similaires à ceux des enfants non autistes et que des sous-groupes d'enfants avaient des symptômes d'autisme moins sévères.  
Par conséquent, la moyenne statistique des données a entraîné l'absence d'hétérogénéité critique.  
La variabilité de l'apprentissage statistique peut aider à comprendre les différences dans les symptômes de l'autisme chez les individus et pourrait être utilisée pour adapter et éclairer les décisions de traitement.

J Autism Dev Disord. 2018 May 31. doi: 10.1007/s10803-018-3625-7.

Statistical Learning is Associated with Autism Symptoms and Verbal Abilities in Young Children with Autism

Author information

1
Weill Cornell Medicine, The Center for Autism and the Developing Brain, 21 Bloomingdale Road, White Plains, NY, 10605, USA. rej2004@med.cornell.edu.
2
Department of Mathematics & Statistics, Wright State University, Dayton, OH, 45435, USA.
3
Weill Cornell Medicine, The Center for Autism and the Developing Brain, 21 Bloomingdale Road, White Plains, NY, 10605, USA.
4
Center for Neural Science, New York University, New York, NY, 10003, USA.

Abstract

Statistical learning-extracting regularities in the environment-may underlie complex social behavior. 124 children, 56 with autism and 68 typically developing, ages 2-8 years, completed a novel visual statistical learning task on an iPad. Averaged together, children with autism demonstrated less learning on the task compared to typically developing children. However, multivariate classification analyses characterized individual behavior patterns, and demonstrated a subset of children with autism had similar learning patterns to typically developing children and that subset of children had less severe autism symptoms. Therefore, statistically averaging data resulted in missing critical heterogeneity. Variability in statistical learning may help to understand differences in autism symptoms across individuals and could be used to tailor and inform treatment decisions.
PMID:29855756
DOI:10.1007/s10803-018-3625-7