Novel interstitial 2.6 Mb deletion on 9q21 associated with multiple congenital anomalies

Traduction: G.M.

Am J Med Genet A. 2014 Jan;164A(1):237-42.

Nouvelle délétion interstitielle de 2,6 Mb sur 9q21 associée à des anomalies congénitales multiples

Pua HH, Krishnamurthi S, Farrell J, Margeta M, Ursell PC, Powers M, Slavotinek AM, Jeng LJ.

Résumé

L' hybridation génomique comparative ( aCGH ) est maintenant couramment utilisée pour identifier les modifications du nombre de copies chez les personnes ayant une déficience intellectuelle , une déficience intellectuelle , des troubles du spectre autistique , et/ou des anomalies congénitales multiples .  
Nous rapportons le cas d'un enfant avec des anomalies congénitales multiples et une nouvelle suppression interstitielle 2.6 Mb dans 9q21.32q21.33 détectée par aCGH . Sa présentation clinique inclus des dysmorphies cranio-faciales caractéristiques , une fente palatine , un défaut de la communication interauriculaire, un utérus bicorne , une luxation de la hanche bilatérale , une hypotonie et une pneumonie récurrente .  
Les études parentales par  aCGH étaient négatives pour la perte de copie dans cette région.
À notre connaissance, aucune suppression similaire n'a été signalée dans les bases de données disponibles ou de la littérature publiée .  

Cette délétion comprend 12 gènes , et des algorithmes de prédiction ainsi que les données expérimentales suggèrent qu'un sous-ensemble est susceptible d'être haploinsuffisant (Note de traduction: l'absence d'un allèle d'un gène l'empêche d'assurer son rôle) . Sont inclus un récepteur de neurotrophine ( NKG2D ) , un gène impliqué dans la fonction de cils ( KIF27 ) , un adaptateur protéinique important pour le contrôle de la qualité des protéines dépendant de l'ubiquitine ( UBQLN1 ), un gène important pour la transcription et de signalisation ( HNRNPK ) , et un gène impliqué dans le maintien de la stabilité génomique ( RMI1 ) .  
Identifier les patients supplémentaires avec des pertes de copie similaires et une étude plus approfondie de ces gènes contribuera à une meilleure compréhension de la physiopathologie de multiples anomalies congénitales .

Abstract

Array comparative genomic hybridization (aCGH) is now commonly used to identify copy number changes in individuals with developmental delay, intellectual disabilities, autism spectrum disorders, and/or multiple congenital anomalies. We report on an infant with multiple congenital anomalies and a novel 2.6 Mb interstitial deletion within 9q21.32q21.33 detected by aCGH. Her clinical presentation included dysmorphic craniofacial features, cleft palate, atrial septal defect, bicornuate uterus, bilateral hip dislocation, hypotonia, and recurrent pneumonia. Parental aCGH studies were negative for copy loss in this region. To our knowledge, no similar deletions have been reported in available databases or published literature. This deletion encompasses 12 genes, and prediction algorithms as well as experimental data suggest that a subset is likely to be haploinsufficient. Included are a neurotrophin receptor (NKG2D), a gene implicated in cilia function (KIF27), an adaptor protein important for ubiquitin-dependent protein quality control (UBQLN1), a gene important for transcription and signaling (HNRNPK), and a gene involved in maintaining genomic stability (RMI1). Identifying additional patients with similar copy losses and further study of these genes will contribute to a better understanding of the pathophysiology of multiple congenital anomalies.
© 2013 Wiley Periodicals, Inc.

PMID: 24501764