Dysbiose microbienne intestinale chez les enfants indiens avec un diagnostic de "trouble du spectre de l'autisme"

Aperçu: G.M.

Le "trouble du spectre de l'autisme" (TSA) est un terme associé à un groupe de troubles neurodéveloppementaux. L'étiologie des TSA n'est pas encore complètement comprise; Cependant, un trouble dans l'axe intestin-cerveau apparaît comme un facteur important conduisant à l'autisme. Pour identifier la composition taxonomique et les marqueurs associés aux TSA, les chercheurs ont comparé le microbiote fécal de 30 enfants autistes diagnostiqués selon le score CARS (Childhood Autism Rating Scale), l'outil diagnostique INCLEN modifié par AIIMS pour le "trouble du spectre de l'autisme "(INDT-ASD). et l'échelle indienne pour l'évaluation de l'autisme (ISAA), avec 24 enfants sans trouble, appariés selon la famille dans la population indienne en utilisant le séquençage de nouvelle génération (NGS) de l'amplicon du gène de l'ARNr 16S. 

L'étude a montré une dysbiose importante dans le microbiome intestinal des enfants avec un diagnostic de TSA, avec une abondance relative plus élevée des familles Lactobacillaceae, Bifidobacteraceae et Veillonellaceae, alors que le microbiome intestinal des enfants sans trouble était dominé par la famille des Prevotellaceae. Une méta-analyse comparative avec un ensemble de données publiquement disponibles de la population américaine composée de 20 TSA et de 20 échantillons témoins d'enfants sans troubles du même âge, a révélé une abondance significativement élevée du genre Lactobacillus chez les enfants autistes des deux populations. 

Les résultats révèlent la dysbiose microbienne et une association de certaines espèces de Lactobacillus avec le microbiome intestinal des enfants autistes.

Microb Ecol. 2018 Mar 21. doi: 10.1007/s00248-018-1176-2.

Gut Microbial Dysbiosis in Indian Children with Autism Spectrum Disorders

Pulikkan J¹, Maji A², Dhakan DB², Saxena R², Mohan B¹, Anto MM³, Agarwal N⁴, Grace T^5,6, Sharma VK⁷.

Author information

1

Department of Genomic Science, Central University of Kerala, Kasaragod, India.

2

Metagenomics and Systems Biology Group, Department of Biological Sciences, Indian Institute of Science Education and Research Bhopal, Bhopal, India.

3

Department of Psychology, Prajyoti Niketan College, Pudukad, Kerala, India.

4

Department of Paediatrics and Neurology, Mahaveer Institute of Medical Science, Bhopal, India.

5

Department of Genomic Science, Central University of Kerala, Kasaragod, India. tonygrace@cukerala.ac.in.

6

Division of Biology, Kansas State University, Manhattan, KS, USA. tonygrace@cukerala.ac.in.

7

Metagenomics and Systems Biology Group, Department of Biological Sciences, Indian Institute of Science Education and Research Bhopal, Bhopal, India. vineetks@iiserb.ac.in.

Abstract

Autism spectrum disorder (ASD) is a term associated with a group of neurodevelopmental disorders. The etiology of ASD is not yet completely understood; however, a disorder in the gut-brain axis is emerging as a prominent factor leading to autism. To identify the taxonomic composition and markers associated with ASD, we compared the fecal microbiota of 30 ASD children diagnosed using Childhood Autism Rating Scale (CARS) score, DSM-5 approved AIIMS-modified INCLEN Diagnostic Tool for Autism Spectrum Disorder (INDT-ASD), and Indian Scale for Assessment of Autism (ISAA) tool, with family-matched 24 healthy children from Indian population using next-generation sequencing (NGS) of 16S rRNA gene amplicon. Our study showed prominent dysbiosis in the gut microbiome of ASD children, with higher relative abundances of families Lactobacillaceae, Bifidobacteraceae, and Veillonellaceae, whereas the gut microbiome of healthy children was dominated by the family Prevotellaceae. Comparative meta-analysis with a publicly available dataset from the US population consisting of 20 ASD and 20 healthy control samples from children of similar age, revealed a significantly high abundance of genus Lactobacillus in ASD children from both the populations. The results reveal the microbial dysbiosis and an association of selected Lactobacillus species with the gut microbiome of ASD children.

PMID:29564487

DOI:10.1007/s00248-018-1176-2