Mutation Screening of the Neurexin 1 Gene in Thai Patients with Intellectual Disability and Autism Spectrum Disorder

Traduction: G.M.

Genet Test Mol Biomarkers. 2014 May 15.

Dépistage de mutation du gène de la Neurexin 1 Gene chez les patients thaïlandais avec déficience intellectuelle et troubles du spectre autistique

Yangngam S¹, Plong-On O, Sripo T, Roongpraiwan R, Hansakunachai T, Wirojanan J, Sombuntham T, Ruangdaraganon N, Limprasert P.

1 Graduate Program in Biomedical Sciences, Faculty of Medicine, Prince of Songkla University , Hat Yai, Songkhla, Thailand .

Résumé

Objet

Neurexin 1 a deux principales protéines isoformes utilisant des promoteurs alternatifs , codant pour les gènes de l'alpha - neurexine 1 ( α - NRXN1 ) et de bêta- neurexine 1 ( β - NRXN1 ).
Cette étude vise à explorer la possibilité que des variantes du gène NRXN1 prédisposent à la déficience intellectuelle (DI) et aux troubles du spectre autistique (TSA ) .

Méthodes

Les régions codantes de 24 exons et les frontières exon-intron (source Wiki : Chez les organismes eucaryotes, les exons sont les fragments d’un ARN primaire qui se retrouvent dans l’ARN cytoplasmique après épissage, par opposition aux introns (fragments d’ARN primaire éliminés au cours de l’épissage)  du gène NRXN1 ont été étudiées chez 115 patients thaïlandais avec DI et TSA par séquençage direct de l'ADN .

Résultats

Neuf nouveaux variants du gène NRXN1 ont été identifiés . Quatre nouveaux variants ont été trouvées dans le gène β - NRXN1 , une variante de six GGC répète dans l'exon 1 , et de trois variantes de la 5 'UTR . Cinq nouveaux variants ont été identifiés dans le gène α - NRXN1 , quatre variantes introniques (Un segment d'un gène situé entre les exons qui est enlevée avant la traduction de l'ARN messager et ne fonctionnent pas dans le codage pour la synthèse des protéines) et une variante faux-sens dans l'exon 14 ( c.2713T > A ou p.F905I ) .

Conclusion

Le dépistage de la mutation du gène NRXN1 chez les patients avec TSA et DI peut être utile pour identifier les variants potentiels prédisposant à la DI et au TSA. Cependant, d'autres études utilisant l'analyse fonctionnelle des protéines des nouveaux variants sont nécessaires pour une conclusion plus catégorique.

PMID : 24832020

Abstract

Aim: Neurexin 1 has two major protein isoforms using alternative promoters, coding for the alpha-neurexin 1 (α-NRXN1) and beta-neurexin 1 (β-NRXN1) genes. This study is to explore the possibility that variants of the NRXN1 gene predispose to intellectual disability (ID) and autism spectrum disorder (ASD). Methods: The coding regions in 24 exons and exon-intron boundaries of the NRXN1 gene were investigated in 115 Thai patients with ID and ASD by direct DNA sequencing. Results: Nine novel variants of the NRXN1 gene were identified. Four novel variants were found in the β-NRXN1 gene, one variant of six GGC repeats in exon 1, and three variants at the 5'UTR. Five novel variants were identified in the α-NRXN1 gene, four intronic variants and one missense variant in exon 14 (c.2713T>A or p.F905I). Conclusion: Mutation screening of the NRXN1gene in patients with ID and ASD may be useful to identify potential variants predisposing to ID and ASD. However, further studies utilizing protein functional analysis of the novel variants are required for a more definite conclusion.