Screening of 50 Cypriot Patients with Autism Spectrum Disorders or Autistic Features Using 400K Custom Array-CGH

Traduction : G.M.

Biomed Res Int. 2013;2013:843027. Epub 2013 Oct 24.

Dépistage de 50 patients chypriotes avec troubles du spectre autistique ou traits autistiques en utilisant une puce d'hybridation génomique comparative 400K 

Kousoulidou L, Moutafi M, Nicolaides P, Hadjiloizou S, Christofi C, Paradesiotou A, Anastasiadou V, Sismani C, Patsalis PC.

Source

The Cyprus Institute of Neurology and Genetics, P.O. Box 23462, 1683 Nicosia, Cyprus.

Résumé

Les troubles du spectre autistique (TSA) comprennent une entité distincte de troubles neurologiques du développement avec une forte composante génétique . 
Malgré l'identification de plusieurs gènes candidats et des variations du nombre de copies ( CNV ) génomiques étiologiques, la majorité des cas de TSA restent encore non résolus.
Nous avons appliqué l'hybridation génomique comparative sur puce à ADN ( CGH-array ) en utilisant tableau personnalisé Agilent 400K dans la première projection de la population de Chypre pour l'identification des CNV associé au TSA.
Une cohorte de 50 patients avec TSA (G1) , leurs parents ( G2) , 50 témoins normaux appariés ethniquement (G3) , et 80 personnes sans troubles avec des enfants ayant iverses conditions de développement neurologiques ( G4) ont été testés .  
En conséquence , 14 patients étaient porteurs de 20 aberrations potentiellement pathogènes, dont deux étaient de novo . 
La comparaison des quatre groupes de population a révélé une augmentation du taux de variantes associées à des maladies rares chez les parents sans troubles des enfants avec autisme. 
Les données ci-dessus fourni des preuves supplémentaires , en soutenant la complexité de l'étiologie des TSA en comparaison à d'autres troubles du développement impliquant une déficience cognitive .  
De plus , nous avons démontré le bien-fondé d'une approche plus ciblée associant une description clinique précise au dépistage génomique à haute résolution destinés à la population pour définir le rôle de CNV dans l'autisme et l'identification des associations significatives au niveau moléculaire .
  
PMID: 24260744

 

Abstract

Autism spectrum disorders (ASDs) comprise a distinct entity of neurodevelopmental disorders with a strong genetic component. Despite the identification of several candidate genes and causative genomic copy number variations (CNVs), the majority of ASD cases still remain unresolved. We have applied microarray-based comparative genomic hybridization (array-CGH) using Agilent 400K custom array in the first Cyprus population screening for identification of ASD-associated CNVs. A cohort of 50 ASD patients (G1), their parents (G2), 50 ethnically matched normal controls (G3), and 80 normal individuals having children with various developmental and neurological conditions (G4) were tested. As a result, 14 patients were found to carry 20 potentially causative aberrations, two of which were de novo. Comparison of the four population groups revealed an increased rate of rare disease-associated variants in normal parents of children with autism. The above data provided additional evidence, supporting the complexity of ASD aetiology in comparison to other developmental disorders involving cognitive impairment. Furthermore, we have demonstrated the rationale of a more targeted approach combining accurate clinical description with high-resolution population-oriented genomic screening for defining the role of CNVs in autism and identifying meaningful associations on the molecular level.